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新增生存曲线绘制、肿瘤基因通路注释工具


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2023-10-26,Galaxy生信云平台 UseGalaxy.cn 新增 2 个工具。

Cancer Research

  • 生存曲线 Kaplan-Meier curve ploter
  • 肿瘤通路注释 Gene to oncogenic pathway mapper

部分结果展示

生存曲线 Kaplan-Meier curve ploter

生存曲线-不分层:

生存曲线-分层:

生存分析是一种统计方法,用于评估特定群体在一段特定时间内存活或生存的概率。它通常用于研究患者的生存率或存活时间,特别是在临床医学和流行病学研究中。生存分析主要涉及观察患者或个体在一定时间内是否存活,并在研究过程中考虑各种可能的因素,如治疗方法、药物治疗、生活方式等。

肿瘤通路注释 Gene to oncogenic pathway mapper

指定基因所在的列,本工具可以将基因名转换成通路名(TCGA 10 条oncogenic通路和 TCGA 10 条DDR通路)。

注释前:

注释后:

TCGA 10 条 oncogenic 通路:

  • Cell_Cycle
  • Hippo
  • MYC
  • NOTCH
  • NRF2
  • PI3K
  • TGF_Beta
  • RTK_RAS
  • TP53
  • WNT

TCGA 10 条 DDR 通路:

  • BER
  • DR
  • NHEJ
  • NER
  • MMR
  • HR
  • TLS
  • FA
  • NP
  • Other

最后

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