功能描述

这个工具用于进行主成分分析（PCA, Principal Component Analysis），可生成出版级的图形。

工具位置

UseGalaxy.cn > RNA-seq > PCA plot with FactoMineR

数据准备

文件1：矩阵文件

• 第1列：特征，如基因。
• 第2 - 最后一列：样本的值，如表达量。

文件2：样本信息

• 第1列：样本ID。
• 第2列：分组。

使用示例

• 默认参数

• 高级设置
  • 边界线形状：多边形

• 高级设置
  • 边界线形状：无边界线

• 颜色美学
  • 主题：theme_minimal

• 颜色美学
  • 调色板为：JCO

• 图例设置
  • 位置：right

友情提示

使用问题请加入Galaxy中国交流群: 925694514（QQ群，免费加入），或者关注公众号：简说基因。